河上鄉居石侯公祠始建於明朝（一三六八至一六四四年）末年，據侯氏族譜所載，該祠為紀念侯族十七世祖侯居石所建。從正門牌匾的年份推斷，居石侯公祠曾於清朝乾隆二十七年（一七六二年）進行修繕。
居石侯公祠是傳統的三進兩院式建築。前院兩旁建有廂房，中進設有供奉歷代祖先神位的神龕。後進樓高兩層，曾用作村校。現時，居石侯公祠仍是村民祭祖和舉行傳統儀式的場所，也是侯族日常聚會議事的地方。
居石侯公祠正面的鼓台與門框均以紅砂岩建造，紅砂岩是根據傳統用於重要建築物的名貴材料。祠堂的屋脊飾有精緻的灰塑，建築物內外的駝峰、簷板及繫樑所雕刻的吉祥圖案及民間故事，也極為華美。
居石侯公祠於二〇〇三年列為古蹟。